Между людьми и Альянсом, включающим большинство рас, разразилась масштабная война. Люди вынуждены отступать — для достижения победы нужны новые технологии. Отряд «флибустьеров» направляется на встречу с охотником за артефактами в Аномальных Зонах, но из-за предательства союзников они попадают в другой мир (Ветвь Феникса), населённый потомками пропавшего во время Исхода корабля «Феникс». Вместо того чтобы помочь им вернуться домой, эти потомки намерены устранить людей как потенциальную угрозу. В результате борьбы за выживание оставшиеся в живых «флибустьеры», ставшие настоящими пиратами, всё же возвращаются домой на захваченном боевом корабле, который объединил в себе артефакты древнего народа и новейшие технологии людей из Ветви Феникса.